2016-2017 Sezonu Spor Toto 2 ve 3. Lig fikstürleri TFF'nin Beykoz Riva'da yer alan idari merkezindeki Orhan Saka Salonu'nda çekildi. Kura çekimine TFF Yönetim Kurulu ve İcra Kurulu Üyesi Ali Düşmez, Sponsorluklar ve Pazarlama'dan Sorumlu Yönetim Kurulu Üyesi Mustafa Çağlar, Genel Sekreter Kadir Kardaş, Genel Sekreter Yardımcısı Özcan Şepik, Maç Planlama Müdürü Besim Yalçın ile kulüp temsilcileri katıldı. Pazarspor adına kura çekimine Başkan Hüseyin Yangın ve Fut.Şub.Sorumlusu İbrahim Karabekir katıldı. Kura çekimine göre Pazarspor ilk maçını sahasın da Yeşil Bursa A.Ş ile oynarken son maçını da yine sahasın da Dardanelspor A.Ş ile oynayacak.



Spor Toto 2 ve 3. Lig'de sezon 3 Eylül 2016 tarihinde oynanacak maçlarla başlayacak. İlk yarı 18 Aralık 2016 tarihindeki müsabakalarla son bulurken 2. Devre 15 Ocak 2017 tarihinde start alacak. İki ligde de sezon 30 Nisan 2017 tarihindeki karşılaşmalarla son bulacak.